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アイテム
がん研究における公開データセットの活用〜腫瘍免疫のPan-Cancer Analysis〜
https://doi.org/10.15100/00023837
https://doi.org/10.15100/000238377eab909e-ef77-4758-bd5b-991e48db3d12
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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AN00063584-20230624-0009.pdf (11 MB)
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| Item type | ☆紀要論文 / Departmental Bulletin Paper(1) | |||||||||||||
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| 公開日 | 2023-08-01 | |||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||
| タイトル | がん研究における公開データセットの活用〜腫瘍免疫のPan-Cancer Analysis〜 | |||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||
| タイトル | Using Publicly Available Datasets in Cancer Research 〜Pan-Cancer Analysis of Tumor Immunity 〜 | |||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||
| その他（別言語等）のタイトル | ||||||||||||||
| その他のタイトル | シリーズ 最新のがん | |||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||
| 著者 |
松村, 謙臣
× 松村, 謙臣
× 高松, 士朗
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| 言語 | ||||||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||
| 主題 | 公開データセット解析, バイオインフォマティクス, 免疫チェックポイント 阻害剤 mutational signature |
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| 資源タイプ | ||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||
| 資源タイプ | departmental bulletin paper | |||||||||||||
| ID登録 | ||||||||||||||
| ID登録 | 10.15100/00023837 | |||||||||||||
| ID登録タイプ | JaLC | |||||||||||||
| アクセス権 | ||||||||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||||||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||||||||||
| 版 | ||||||||||||||
| 出版タイプ | AM | |||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa | |||||||||||||
| 出版者 名前 | ||||||||||||||
| 出版者 | 近畿大学医学会 | |||||||||||||
| 書誌情報 |
ja : 近畿大学医学雑誌 en : Medical Journal of Kindai University 巻 48, 号 1-2, p. 9-22, 発行日 2023-06-24 |
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| ISSN | ||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | EISSN | |||||||||||||
| 収録物識別子 | 24327190 | |||||||||||||
| 内容記述 | ||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||
| 内容記述 | 現在，がんに関してさまざまなゲノムワイドな解析を行ったデータセットが公開されている．最近我々は，公開データセットだけを用いて免疫チェックポイント阻害剤（ICI）の感受性を予測するプログラムを作成した．まずThe Canser Genome Atlas のpan-cancer 固形がんの全エクソンシークエンシングデータを解析し，それらの腫瘍がmutational signature によって８種類のgenomic subtype に分類できることを見出した．うち5 種類は腫瘍免疫活性が高く，それらをimmuno-responsive genomic subtype（ irGS）と名付けた．そして腫瘍の全エクソンシークエンシングデータから，腫瘍がirGS か否かを判定するGS-PRACTICE を開発し，ICI を投与した腫瘍にあてはめて検証したところ，ICI の効果を予測できることがわかった．このように，公開データセットはがん研究において非常に役立ち，その活用が推奨される． | |||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||
