@techreport{oai:kindai.repo.nii.ac.jp:00023379, author = {石川, 文洋}, month = {}, note = {https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19K05722/, 研究成果の概要(和文):本研究は, キャリアータンパク質担持型共有結合性異性化酵素阻害剤 (クロスリンク剤) を設計および創製し, 異性化酵素の触媒機構およびキャリアータンパク質認識機構を明らかにすることを目的とした. 本研究では, クロスリンク剤の創製に成功した. また, チロシジン合成酵素TycAをモデルとして、異性化酵素の活性部位変異体を作製した. さらに, 本クロスリンク剤を利用することでGlu882がクロスリンク剤との反応部位であることが明らかとなった. このことから, Glu882が異性化反応においてアミノ酸のα位水素を引き抜く塩基触媒として作用していることが示唆された. 研究成果の概要(英文): Nonribosomal peptide synthetases (NRPSs) unique molecular factories can produce peptides with nonproteinogenic D-amino acids in which the epimerization (E) domain catalyzes the conversion of L-amino acids to D-amino acids, but its mechanism remains not fully understood. Here, we describe the development of pantetheine crosslinking probes that mimic the natural substrate L-Phe of the initiation module of tyrocidine synthetase, TycA, to elucidate and study the catalytic residues of the E domain. Mechanism-based crosslinking assays and MALDI-TOF MS were used to identify both H743 and E882 as the crosslinking site residues, demonstrating their roles as catalytic bases. Mutagenesis studies further validated these results and allowed the comparison of reactivity between the catalytic residues, concluding that glutamate acts as the dominant nucleophile in the crosslinking reaction, resembling the deprotonation of the Ca-H of amino acids in the epimerization reaction., 研究種目:基盤研究(C); 研究期間:2019~2021; 課題番号:19K05722; 研究分野:ケミカルバイオロジー; 科研費の分化・細目:, application/pdf}, title = {NRPS異性化酵素機能を解明する共有結合型分子ツールの開発}, year = {2021}, yomi = {イシカワ, フミヒロ} }