@techreport{oai:kindai.repo.nii.ac.jp:00022379,
 author = {宮下, 尚之 and 米澤, 康滋},
 month = {},
 note = {https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17K00421/ | https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17K00421/, 研究成果の概要（和文）：アルツハイマー病の初期分子過程ではまずアミロイド前駆体タンパク質（APP）がベータ切断酵素によって切断される。その後ガンマ切断酵素によって切断され、アミロイドβペプチドが産生される。本研究では、APPとベータ切断酵素との相互作用過程に注目した。まず、ベータ切断酵素の膜貫通部位の構造が解かれていなかったので、レプリカ交換分子動力学法（REMD）を用い立体構造を予測した。その構造を元にして粗視化モデルシミュレーションを行い、APPの膜貫通部位とベータ切断酵素の膜貫通部位の相互作用ポイントを明らかにした。更にα切断酵素の膜貫通部位の構造予測をし、α切断酵素とAPPの相互作用も明らかにした。研究成果の概要（英文）： In the early stage of Alzheimer's disease, amyloid precursor protein (APP) is cleaved by beta-secretase, then it is cleaved by gamma-secretase, and Amyloid beta-peptide is produced. In this research, we have focused on the interaction between APP and beta-secretase in the membrane. The transmembrane (TM) regions of beta-secretase have not been solved the tertiary structure. Thus, we performed the replica exchange molecular dynamics (REMD) simulation to predict the tertiary structure of the TM domain of beta-secretase. Then, we performed coarse-grained model molecular dynamics simulations of the TM domain of beta-secretase and TM domain of APP in the bio-membrane to reveal the interaction mechanism between APP and beta-secretase. We also cleared the interaction mechanism of APP and alpha-secretase., 研究種目：基盤研究(C);  研究期間：2017～2020;   課題番号：17K00421;   研究分野：分子シミュレーション・医療情報;   科研費の分科・細目：, application/pdf},
 title = {分子シミュレーションによるアルツハイマー病初期分子機構への生体膜環境の影響解析},
 year = {2021},
 yomi = {ミヤシタ, ナオユキ and ヨネザワ, ヤスシゲ}
}