WEKO3
アイテム
RNAシークエンシングを用いた進行型多発性硬化症に対するバイオマーカーの同定
https://kindai.repo.nii.ac.jp/records/21506
https://kindai.repo.nii.ac.jp/records/21506798cedb0-639d-45b9-a52e-2541377c4576
名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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![]() |
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Item type | 研究報告書 / Research Paper(1) | |||||||||
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公開日 | 2021-03-15 | |||||||||
タイトル | ||||||||||
タイトル | RNAシークエンシングを用いた進行型多発性硬化症に対するバイオマーカーの同定 | |||||||||
言語 | ja | |||||||||
タイトル | ||||||||||
タイトル | Identification of biomarkers in animal models of progressive multiple sclerosis using RNA sequencing | |||||||||
言語 | en | |||||||||
著者 |
佐藤, 文孝
× 佐藤, 文孝
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言語 | ||||||||||
言語 | jpn | |||||||||
キーワード | ||||||||||
主題 | バイオインフォマティクス, 多変量解析, ビッグデータ, バイオマーカー 動物モデル 進行型多発性硬化症 | |||||||||
資源タイプ | ||||||||||
資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws | |||||||||
資源タイプ | research report | |||||||||
著者(英) | ||||||||||
en | ||||||||||
SATO, Fumitaka | ||||||||||
著者 所属 | ||||||||||
近畿大学医学部; 助教 | ||||||||||
著者所属(翻訳) | ||||||||||
Kindai University | ||||||||||
著者 役割 | ||||||||||
研究代表者 | ||||||||||
版 | ||||||||||
出版タイプ | NA | |||||||||
出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_be7fb7dd8ff6fe43 | |||||||||
出版者 名前 | ||||||||||
出版者 | 近畿大学 | |||||||||
書誌情報 |
科学研究費助成事業研究成果報告書 (2019) p. 1-12, 発行日 2020 |
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リンクURL | ||||||||||
内容記述タイプ | Other | |||||||||
内容記述 | https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17K15628/ | |||||||||
抄録 | ||||||||||
内容記述タイプ | Abstract | |||||||||
内容記述 | 研究成果の概要(和文):本研究では,病態の異なる二つの進行型多発性硬化症(MS)動物モデルを多変量解析し,末梢バイオマーカーの探索を行った。中枢神経系(CNS)トランスクリプトームデータの主成分分析(PCA)では,プロラクチン減少が病態の進行に関与することを示唆した。CNSと脾臓トランスクリプトームデータのパターンマッチングでは,両モデルに共通して増減する333個のバイオマーカー候補を同定した。それらの中には,MS患者の末梢血中でも同様に増加(PER1/MIR6883とFKBP5)・減少(SLC16A1/MCT1)している遺伝子が含まれており,これらの遺伝子が病態に関与するバイオマーカーとなり得ることを示した。研究成果の概要(英文):We have established two murine models of progressive multiple sclerosis (MS) by sensitizing SJL/J and A.SW mice with myelin oligodendrocyte glycoprotein (MOG). Neuropathologically, SJL/J mice exhibit T cell infiltration in the central nervous system (CNS); A. SW mice develop CNS antibody deposition. In this study, using the two distinct progressive EAE models, we aimed to determine biomarkers contributing to the homogeneity and heterogeneity. Using principal component analysis (PCA) of CNS transcriptome data, we found the down-regulation of CNS prolactin in the two models. Pattern matching analysis of spleen transcriptome with CNS PCA showed 333 splenic surrogate markers including Stfa2l1, which reflected the changes in the CNS. Among the surrogate markers in the spleen, two genes (PER1/MIR6883 and FKBP5) and one gene (SLC16A1/MCT1) were also significantly up-regulated and down-regulated in human MS peripheral blood. This suggests that these genes may be biomarkers in progressive MS. | |||||||||
内容記述 | ||||||||||
内容記述タイプ | Other | |||||||||
内容記述 | 研究種目:若手研究(B); 研究期間:2017~2019; 課題番号:17K15628; 研究分野:神経免疫学; 科研費の分科・細目: | |||||||||
資源タイプ(WEKO2) | ||||||||||
内容記述タイプ | Other | |||||||||
内容記述 | Research Paper | |||||||||
フォーマット | ||||||||||
内容記述タイプ | Other | |||||||||
内容記述 | application/pdf |